También tenemos nuevas fases normales en Nintendo 3DS que incluyen a Inkay, Chimchar, Skiddo, Monferno, Joltik, Gogoat, Loudred, Galvantula, Exploud y Deoxys (fases 251-260) y en Mobile ni más ni menos que 60 fases normales nuevas igualando de esta forma por fin a la versión de Nntendo 3DS. También se han añadido dos nuevas fases extra de Luxray y Malamar y añadido a Mobile todas las fases extra que faltaban para igualar el contenido de ambas.
Además, en exclusiva para Pokémon Shuffle Mobile tenemos se ha añadido una tienda especial donde podemos comprar unos objetos especiales a cambio de dos joyas. Actualmente los objetos disponibles permiten tener vidas ilimitadas durante una hora, aumentar la oportunidad de Ocasión de Oro durante una hora o recuperar las vidas el doble de rápido durante 24 horas. Para aprovechar esta nueva tienda también han puesto una oferta especial de 118 joyas por 68,94€.